Meta sfida Google, con AI ottiene la struttura di 600 milioni di proteine

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E’ sfida a colpi di proteine tra i colossi dell’intelligenza artificiale. Dopo il successo ottenuto dall’azienda britannica DeepMind di Google nel prevedere la struttura 3D di quasi tutte le proteine note alla scienza (oltre 200 milioni) grazie all’algoritmo AlphaFold, ora è il turno di Meta, che annuncia di aver previsto la struttura di oltre 600 milioni di proteine di origine microbica mai caratterizzate finora, una sorta di ‘materia oscura’ della biologia: lo ha fatto grazie all’algoritmo ESMfold, che è 60 volte più veloce ma per il momento meno preciso di AlphaFold. Il risultato è accessibile sul sito bioRxiv, che raccoglie gli articoli non ancora vagliati dalla comunità scientifica.

I ricercatori di Meta hanno usato un modello di intelligenza artificiale che viene già applicato in varie attività linguistiche perché in grado di prevedere un testo a partire da poche lettere o parole. Solitamente questi modelli vengono ‘addestrati’ usando moltissimi testi. In questo caso, invece, sono state usate sequenze di proteine già note, formate dalla combinazione di 20 amminoacidi, ciascuno rappresentato da una lettera. Il sistema ha dunque imparato a completare in maniera automatica la sequenza della proteina come un testo partendo da pochi amminoacidi noti e a usarla per determinare la struttura 3D della proteina.

Come banco di prova, si è deciso di utilizzare le sequenze di Dna recuperate da diverse fonti come il suolo, l’acqua del mare, l’intestino umano, la pelle e altri habitat di microrganismi. La maggior parte delle sequenze di Dna usate proveniva da organismi che non erano mai stati cresciuti in laboratorio e che erano sostanzialmente sconosciuti alla scienza. In totale sono state previste oltre 617 milioni di strutture proteiche in appena due settimane: oltre un terzo di queste previsioni dovrebbe essere di alta qualità e dunque molto affidabile. I risultati sono pubblici e liberamente accessibili, così come il codice alla base del modello di intelligenza artificiale.

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Maurizio Barra

Sono nato a Torino, il 19 Febbraio 1968. Ho alle spalle un'educazione direi Umanistica di base, avendo frequentato il Liceo Classico Valsalice e Lingue e Lettere Moderne all'Università. Grande passione per tutto ciò che è una tastiera, dal pianoforte o simili, ai PC, di cui peraltro amo anche il touch. Inoltre, un'altra mia grande passione, è lo sport e mi ha molto coinvolto, siccome ho lavorato molto su di me negli anni, passando attraverso varie fasi, nelle quali sono ingrassato moltissimo e poi sono diventato assai magro, dunque, siccome più volte ho dovuto intervenire su di me, ho voluto approfondire questo discorso ed ho conseguito il Master CFT come Personal Fitness Trainer presso Issa Italia. La voglia e l'interesse ad approfondire tante tematiche e la curiosità olistica, alle volte giocano brutti scherzi, perchè si rischia di iniziare tutto e concretamente di non riuscire a concludere nulla. Bisogna in teoria scegliere cosa fare da grande, il fatto è che io sono già ben cresciuto ed ora mi sento assai coinvolto dall'ambito tecnologico e dunque spero, soprattutto, di essere un intermediario tra i vedenti, diciamo, o comunque tra tutti e proprio chi è non vedente come me, sia per mostrare quante cose si possono fare in autonomia, sia per avvicinare (e qui mi appello a sviluppatori, amanti di softwares etc...) la facilità e l'accesso all'uso completo della tecnologia anche da parte degli stessi non vedenti, che comunque si devono spesso scontrare con grafici, pagine poco accessibili e continui escamotage, per fare cose che, con il famoso click, in teoria si risolvono subito e questo poi non è sempre vero; in sostanza lo scopo o l'idea sono quelli di avvicinare i vedenti, sviluppatori di apps e siti, a renderle più accessibili, metendo dunque a disposizione la mia conoscenza delle Tecnologie Assistive (Assistive Tecnologies) di cui mi ritengo un buon conoscitore. Non parliamo poi delle Apps Mobili ed anche di quel mondo, davvero meraviglioso ed il cui approccio per me è stato direi facile, ma mi rendo conto che non è così per tutti. Quindi, spero, nel tempo, di mettere a disposizione la mia modestissima ed umile e piccola esperienza, mantenendo vivo ogni nuovo possibile fronte di apprendimento e confronto e conoscenza, tutti utili e sempre necessari, non si smette mai di imparare e neanche di confrontarsi. Dunque, spero di avervi con me, sempre più numerosi, lungo questo nuovo cammino! Inoltre, siccome la tecnologia non è soltanto procedure, tutorials su come usare un sistema operativo o su come riparare PC, ma offre anche molti strumenti di consultazione, visione, ascolto, cercherò di condividere con voi le mie impressioni e quindi files, contenuti multimediali o altro, non avranno soltanto attinenza tecnologica, ma qualcosa a che fare con la rete l'avranno. Anzi, sono benvenuticommenti, suggerimenti e proposte. Con il trascorrere del tempo, il sito ha preso la direzione informativa. Pur essendo da solo a gestire tutta questa mole di notizie, prometto di dare sempre il massimo per fornire tutte le notizie il più possibile aggiornate in tempo reale, relative a tantissime categorie: Mondo, Cronaca, Economia, Politica, Tecnologia, Scienza, Medicina, Spettacoli, Cinema, Musica, Cultura, Calcio e sport, Regione Piemonte, tutto, ma proprio tutto, sulla Juventus e molto, molto altro. Grazie a tutti!

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